2016年10月17日，上海合作组织秘书长阿利莫夫向新当选的联合国秘书长古特雷斯发去贺信。他在信中表示：
“您曾经作为联合国难民事务高级专员所从事的工作和丰富的经验表明，您是一个进取和有远见的人，做好了应对当前和潜在威胁的准备。我深信，凭借您进步的思想，一定能够在当前不平静的时期成功地领导联合国。
上海合作组织十多年来高度重视同联合国及其下属机构的协作。自从2004年12月2日通过联合国大会关于给予上合组织联大观察员地位的第59/48号决议，以及2010年4月5日签署关于上合组织秘书处和联合国秘书处合作的联合宣言，我们成功地建立了紧密的伙伴关系和密切协作。鉴此有必要指出，当前联合国和上合组织的合作为推动与巩固地区及国际伙伴关系，解决复杂的区域问题发挥着核心作用。此外，相信我们的高效合作已成为互惠互利对话的典范，确保成功应对现代威胁和挑战。”
阿利莫夫祝愿古特雷斯在这一重要岗位上取得辉煌成就，表示上合组织将给予其全力支持。
 
2016年10月13日，联合国联大会议任命葡萄牙前总理、联合国难民事务高级专员古特雷斯为新任联合国秘书长。古将于2017年1月1日履新。