国家元首理事会是上合组织最高机构，负责确定本组织活动的优先领域和基本方向，决定其内部架构和运行机制、与其他国家及国际组织相互协作的原则性问题,同时研究最具紧迫性的国际问题。

元首理事会例行会议每年举行一次。会议主办国元首担任国家元首理事会主席。例会举办地按惯例根据本组织成员国国名俄文字母的排序确定。

2026年8月31日至9月1日，在吉尔吉斯共和国主持下，上海合作组织成员国元首理事会第二十六次会议在比什凯克举行。会议通过一揽子重要文件。

成员国元首理事会会议共审议通过 28 份文件，包括《上海合作组织二十五周年比什凯克宣言》、批准修改和补充《上海合作组织宪章》议定书、《上海合作组织成员国元首理事会关于加强对受紧急情况影响的国家援助响应能力的声明》，以及本组织重点工作领域的其他多项声明。会议决定签署《上海合作组织秘书处与非洲联盟委员会谅解备忘录》，批准《上合组织成员国应对安全威胁与挑战综合中心条例》和《上合组织禁毒中心执行委员会条例》。

白俄罗斯共和国总统卢卡申科、印度共和国总理莫迪、伊朗伊斯兰共和国总统佩泽希齐扬、哈萨克斯坦共和国总统托卡耶夫、中华人民共和国主席习近平、巴基斯坦伊斯兰共和国总理夏巴兹・谢里夫、俄罗斯联邦总统普京、塔吉克斯坦共和国总统拉赫蒙、乌兹别克斯坦共和国总统米尔济约耶夫、上海合作组织秘书长叶尔梅克巴耶夫、上海合作组织地区反恐怖机构执委会主任沙尔舍耶夫出席会议。

本次峰会重点讨论了政治、安全、贸易、投资、能源、工业、生态、旅游、新兴技术等各领域多边合作，以及关于完善上合组织工作及与国际议程相关问题。讨论期间，各成员国元首就进一步深化上合组织合作提出了一系列倡议。

上合组织成员国元首理事会第二十六次会议，是吉尔吉斯斯坦担任2025至2026年度上合组织轮值主席国工作的收官活动。本届主席国工作以“上合组织成立25 周年：携手迈向可持续和平、发展与繁荣”为口号。会议决定由巴基斯坦接任2026至2027年度上海合作组织轮值主席国。巴方领导人确定其轮值主席国口号为“从愿景到行动：互联互通、创新与共同繁荣”。