2016年10月20日，上海合作组织成员国教育部长第六次会议在杜尚别举行。
会议就上合组织成员国国家教育系统发展和现代化，合作优先方向，履行关于落实上合组织成员国政府间教育合作协定的措施清单等问题交换了意见。审议了上合组织成员国关于建立和运行上海合作组织大学的政府间协议草案，讨论了教育领域合作的一系列其他重要问题。
中华人民共和国教育部和俄罗斯联邦教育科学部代表，向与会人员通报了在中国和俄罗斯上合大学成员校，分别提升其汉语和俄语教师水平的情况。
上合组织成员国教育部长们高度关注关于上合组织地区教学流动性的现状和法律保障的报告。
与会人员指出，上合大学项目能够有效拉近各国高等教育系统的关系，保障教育资源一体化，为深化上合组织框架下教育伙伴关系创造新的可能。关于建立上合大学的文件完成了商谈阶段，并经成员国校和上合国家教育部签署。部长们认为，下一步项目落实工作是签署政府间协议，为上合大学新的发展阶段，以及其他现有科教合作的进一步发展铺平道路，为建立上合组织统一教育空间找寻新的路径。
各方商定2018年举行上合组织成员国教育部长第七次会议。
2006年在上海签署的《上海合作组织成员国政府间教育合作协定》为教育合作成功开展奠定了法律基础。
上合组织成员国教育部长会议按例每两年举行一次，讨论本组织高等院校发展的重要问题。第五次会议于2014年在巴尔瑙尔举行。